防霉劑能有效抑制或制止霉菌和細菌等微生物在水性涂料中大量繁殖，同時也要避免在成膜后墻體上長霉。一些低品質的涂料常使用一些汞類、錫類等重金屬化合物，它們的殺菌、抑菌能力很強，但毒性也大，而高品質的涂料會采用低毒或無毒的非汞型防霉劑，都是一些有機類化合物。
1、有機酸

如丙酸、山梨酸、苯甲酸、乙酸、脫氫乙酸和富馬酸等。它們主要以未電離分子的形式破壞微生物細胞及細胞膜或細胞內的酶，使酶蛋白失活而不能參與催化。如苯甲酸能抑制微生物細胞內呼吸酶的活性以及阻礙乙酰輔酶的縮合反應而使三羧酸循環受阻，代謝受影響，并可阻礙細胞膜的透性。山梨酸可與細菌酶系統中琉基相結合，從而破壞許多酶系統達到抑制霉菌作用。錐形轉子電動機其中丙酸應用最廣，因為它抑菌效果和價格低廉，但由于它的腐蝕性和刺激性使其應用受到一定局限。

 2、有機酸鹽或酮

如丙酸鈣、山梨酸鈉、苯甲酸鈉、富馬酸二甲酯等，它們的腐蝕性小、使用安全，尤以其中的丙酸鈣被廣泛應用。它們只有在鹽類轉化為相應的有機酸時才有抑制霉菌的作用，這必須在有一定水份含量和低pH的條件下才能進行。它們的防霉效果比相應的有機酸差。

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